Indikaattoribakteerien resistenssi

Terveiden eläimien suoliston normaaliin mikrobistoon kuuluvien, nk. indikaattoribakteerien resistenssin katsotaan kuvaavan mikrobilääkkeiden käytön aiheuttamaa vastustuskykyisten tyyppien valintapainetta. Indikaattoribakteerit voivat ylläpitää resistenssitekijöiden (geenien) varastoa, josta tekijät voivat sopivissa olosuhteissa siirtyä tauteja aiheuttaviin bakteereihin.

FINRES-Vet-ohjelmassa tutkitaan tuotantoeläinten suolistosta eristettyjen Escherichia coli -, Enterococcus faecalis - ja Enterococcus faecium -bakteerien mikrobilääkeresistenssiä. Vuosina 2002,  2005 ja 2008 indikaattoribakteereita eristettiin broilereista, vuonna 2003,  2006 ja 2009 naudoista sekä vuosina 2004 ja 2007 sioista. Bakteerit eristetään teurastamoilta kerättävistä suolinäytteistä. Näytteitä otetaan suhteessa eläinten teurastusmääriin; mukana olleissa teurastamoissa teurastetaan 85–100 % Suomessa teurastetuista elämistä. Näytteitä kerätään kultakin tilalta (naudat ja siat) tai kustakin kasvatuserästä (broilerit) yksi.